Hoàn thuế GTGT dự án đầu tư giúp doanh nghiệp thu hồi sớm số thuế đầu vào lớn bị "đọng" khi xây nhà xưởng, mua máy móc. Nhiều hồ sơ chỉ được kết chuyển kỳ sau vì chưa góp đủ vốn hoặc thiếu giấy phép ngành nghề. Nghị định 181/2025/NĐ-CP đã quy định lại điều kiện và thêm hạn nộp hồ sơ khi dự án hoàn thành.
Trả lời nhanh: Doanh nghiệp khai thuế khấu trừ, có dự án đang trong giai đoạn đầu tư, sau khi bù trừ với thuế phải nộp của hoạt động hiện có mà thuế GTGT đầu vào còn từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn. Không đủ vốn điều lệ hoặc điều kiện kinh doanh chỉ được kết chuyển.
Điều kiện hoàn thuế GTGT dự án đầu tư
Hoàn thuế GTGT dự án đầu tư là việc ngân sách trả lại thuế GTGT đầu vào của giai đoạn đầu tư mà doanh nghiệp chưa khấu trừ hết. Theo Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15 và Điều 30 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, cần đáp ứng đồng thời:
- Đã đăng ký kinh doanh và nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ.
- Có dự án đầu tư theo pháp luật về đầu tư (dự án mới, mở rộng, hoặc chia nhiều giai đoạn, hạng mục).
- Dự án đang trong giai đoạn đầu tư.
- Sau khi bù trừ với số thuế phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh hiện có, số thuế đầu vào của dự án còn lại từ 300 triệu đồng trở lên.
Phân tích theo quy định trước đây có tại bài hoàn thuế GTGT dự án đầu tư.
Ví dụ minh họa: Quý III/2026, Công ty Y có thuế GTGT phải nộp của hoạt động hiện có 120 triệu đồng, thuế đầu vào của dự án nhà xưởng 500 triệu đồng. Sau bù trừ còn 500 − 120 = 380 triệu đồng, đạt mức đề nghị hoàn. Nếu chỉ còn 250 triệu đồng, công ty kết chuyển sang kỳ sau.
Trường hợp dự án đầu tư không được hoàn thuế GTGT
Dự án không đủ điều kiện hoàn thì số thuế đầu vào không mất mà được kết chuyển sang kỳ sau. Các trường hợp chỉ được kết chuyển:
- Chưa góp đủ vốn điều lệ như đã đăng ký tại thời điểm nộp hồ sơ hoàn thuế.
- Dự án thuộc ngành, nghề kinh doanh có điều kiện nhưng chưa đủ điều kiện kinh doanh; hoặc bị thu hồi giấy phép, không còn đáp ứng điều kiện trong quá trình hoạt động.
- Dự án khai thác tài nguyên, khoáng sản (trừ dự án tìm kiếm, thăm dò, phát triển mỏ dầu khí) và dự án sản xuất sản phẩm từ tài nguyên, khoáng sản theo quy định tại Nghị định 181/2025.
Dự án ngành nghề có điều kiện vẫn được hoàn nếu đã có giấy phép, giấy chứng nhận hoặc văn bản chấp thuận, đang trong thời gian đề nghị cấp, hoặc pháp luật chuyên ngành không yêu cầu loại giấy này.
Hạn nộp hồ sơ khi dự án đã hoàn thành
Theo Điều 30 Nghị định 181/2025, dự án đã hoàn thành mà chưa đề nghị hoàn thì doanh nghiệp nộp hồ sơ trong thời hạn 01 năm kể từ ngày dự án, giai đoạn hoặc hạng mục đầu tư hoàn thành. Ngày hoàn thành là ngày phát sinh doanh thu đầu tiên; doanh thu chạy thử, doanh thu hoạt động tài chính và thanh lý nguyên vật liệu không tính.
Dự án chấm dứt trước khi đi vào hoạt động, không phát sinh thuế GTGT đầu ra, phải nộp lại số thuế đã được hoàn; số chưa hoàn không được giải quyết.
Lưu ý tránh bị từ chối hoàn thuế GTGT dự án đầu tư
Hồ sơ hoàn thuế GTGT dự án đầu tư thường bị từ chối do thiếu chứng minh hơn là do không đủ điều kiện. Bạn nên kiểm tra:
- Hóa đơn đầu vào hợp pháp, khoản từ 5 triệu đồng có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt.
- Theo dõi riêng thuế đầu vào của dự án, tách khỏi hoạt động hiện có.
- Biên bản góp vốn, sao kê chứng minh đã góp đủ vốn điều lệ tại thời điểm nộp hồ sơ.
- Giấy phép, văn bản chấp thuận nếu dự án thuộc ngành nghề có điều kiện.
- Hồ sơ xác định giai đoạn, hạng mục đầu tư và thời điểm hoàn thành.
Từ 01/01/2026, Luật số 149/2025/QH15 đã bỏ điều kiện hoàn thuế "người bán đã kê khai, nộp thuế", giảm rủi ro bị từ chối vì nhà cung cấp chưa nộp thuế. Thành phần hồ sơ xem bài hồ sơ hoàn thuế GTGT theo quy định mới.
Câu hỏi thường gặp về hoàn thuế GTGT dự án đầu tư
Dự án khởi công trước 01/7/2025 áp dụng quy định nào?
Theo hướng dẫn hiện hành, dự án còn trong giai đoạn đầu tư khi Nghị định 181/2025 có hiệu lực (01/7/2025) được xét hoàn theo Điều 30 Nghị định này; doanh nghiệp nên đối chiếu với cơ quan thuế quản lý đối với số thuế phát sinh trước ngày này.
Số thuế đầu vào dưới 300 triệu đồng xử lý thế nào?
Doanh nghiệp kết chuyển sang kỳ tính thuế tiếp theo, cộng dồn đến khi đạt mức 300 triệu đồng thì đề nghị hoàn.
Bị từ chối hoàn thì số thuế có mất không?
Không. Số thuế đủ điều kiện khấu trừ được kết chuyển kỳ sau; doanh nghiệp bổ sung điều kiện còn thiếu rồi đề nghị hoàn ở kỳ tiếp theo.
Chuẩn bị hồ sơ hoàn thuế GTGT dự án đầu tư ngay từ đầu
Hoàn thuế GTGT dự án đầu tư thuận lợi khi doanh nghiệp góp đủ vốn, có đủ giấy phép và theo dõi riêng thuế đầu vào từ khi khởi công.
Liên hệ Luật Dân Việt để được tư vấn
Nếu bạn cần rà soát hồ sơ hoặc muốn Luật Dân Việt thực hiện thủ tục thay, hãy liên hệ để được tư vấn cụ thể theo tình huống của doanh nghiệp:
- Hotline: 0858.111.929
- Email: tuvanluatdanviet@gmail.com
- Văn phòng Hà Nội: 219 Trung Kính, Yên Hoà, Hà Nội; Toà HH2, FLC Garden City, Đại Mỗ, Hà Nội
Căn cứ pháp lý
- Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15, được sửa đổi, bổ sung bởi Luật số 149/2025/QH15 và Luật số 09/2026/QH16.
- Nghị định số 181/2025/NĐ-CP quy định chi tiết Luật Thuế giá trị gia tăng (Điều 30).
- Nghị định số 174/2025/NĐ-CP quy định giảm thuế giá trị gia tăng theo Nghị quyết số 204/2025/QH15.
- Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15.
- Nghị định số 252/2026/NĐ-CP hướng dẫn Luật Quản lý thuế.
- Thông tư số 89/2026/TT-BTC hướng dẫn Luật Quản lý thuế và Nghị định số 252/2026/NĐ-CP.
Thông tin trong bài mang tính tham khảo, được cập nhật theo văn bản pháp luật có hiệu lực tại thời điểm đăng. Quy định có thể thay đổi; vui lòng đối chiếu văn bản gốc hoặc liên hệ luật sư trước khi thực hiện.
