Bỏ sót hóa đơn đầu ra, kê trùng hóa đơn đầu vào là sai sót thường gặp trên tờ khai GTGT. Khai bổ sung thuế GTGT là cách tự sửa sai hợp pháp, giúp tránh bị phạt khai sai nếu làm trước khi cơ quan thuế phát hiện. Từ 01/7/2026, thủ tục này thực hiện theo Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15, Nghị định 252/2026/NĐ-CP và Thông tư 89/2026/TT-BTC.
Trả lời nhanh: Khai bổ sung thuế GTGT được thực hiện trong 05 năm kể từ ngày hết hạn nộp tờ khai của kỳ có sai sót, trước khi cơ quan thuế công bố quyết định thanh tra, kiểm tra. Nếu làm tăng số thuế phải nộp, doanh nghiệp nộp thêm tiền thuế và tiền chậm nộp 0,03%/ngày.
Khi nào phải khai bổ sung thuế GTGT?
Khai bổ sung thuế GTGT là việc lập lại hồ sơ cho kỳ đã nộp khi phát hiện sai, sót làm thay đổi số thuế phải nộp, được khấu trừ hoặc đề nghị hoàn.
Theo khoản 5 Điều 12 Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15, bạn được khai bổ sung trong 05 năm (luật cũ là 10 năm) kể từ ngày hết hạn nộp hồ sơ của kỳ có sai sót, trong các trường hợp:
- Trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra, kiểm tra.
- Hồ sơ không thuộc phạm vi, thời kỳ ghi trong quyết định thanh tra, kiểm tra.
Sai sót thuộc thời kỳ đã thanh tra, kiểm tra thì bạn nộp hồ sơ giải trình; cơ quan thuế chấp nhận mới được điều chỉnh.
Cách khai bổ sung thuế GTGT theo Thông tư 89/2026
Cách khai bổ sung thuế GTGT phụ thuộc vào việc sai sót ảnh hưởng đến chỉ tiêu nào. Quy trình chung:
- Xác định ảnh hưởng của sai sót: tăng thuế phải nộp, giảm thuế còn được khấu trừ, hay liên quan số đã đề nghị hoàn.
- Lập hồ sơ khai bổ sung trên hệ thống thuế điện tử, gồm mẫu 01/KHBS (kèm phụ lục 01-1/KHBS) theo Thông tư 89/2026/TT-BTC.
- Phản ánh chênh lệch khấu trừ vào chỉ tiêu "Điều chỉnh tăng/giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ của các kỳ trước" trên tờ khai kỳ phát hiện sai sót.
- Nộp tiền thuế tăng thêm và tiền chậm nộp tự xác định.
| Tình huống | Cách xử lý |
|---|---|
| Tăng thuế phải nộp | Khai bổ sung, nộp thêm tiền thuế và tiền chậm nộp |
| Giảm thuế còn được khấu trừ, chưa đề nghị hoàn | Kê vào chỉ tiêu điều chỉnh giảm trên tờ khai kỳ phát hiện |
| Đã đề nghị hoàn, chưa được hoàn | Gửi văn bản đề nghị hủy hồ sơ hoàn, khai giảm số đề nghị hoàn |
| Đã được hoàn | Khai giảm số hoàn, nộp lại số thu hồi kèm tiền chậm nộp |
Cách làm cũ có tại bài khai bổ sung tờ khai thuế GTGT theo Thông tư 80; từ 01/7/2026, biểu mẫu áp dụng theo Thông tư 89/2026/TT-BTC.
Tiền chậm nộp khi khai bổ sung thuế GTGT
Tiền chậm nộp là khoản người nộp thuế phải trả khi nộp tiền thuế sau thời hạn, mức 0,03%/ngày trên số thuế chậm nộp (khoản 2 Điều 16 Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15). Số ngày tính từ ngày liền kề sau hạn nộp thuế đến ngày liền kề trước ngày nộp tiền, kể cả ngày nghỉ (Điều 26 Nghị định 252/2026/NĐ-CP).
Ví dụ minh họa: Công ty D khai thuế GTGT theo tháng. Tháng 10/2026, kế toán phát hiện bỏ sót một hóa đơn đầu ra của tháng 3/2026, làm thiếu 40 triệu đồng thuế GTGT. Hạn nộp thuế tháng 3/2026 là 20/4/2026 (kỳ này không thuộc diện gia hạn).
- Công ty khai bổ sung và nộp tiền ngày 30/10/2026.
- Số ngày chậm nộp: từ 21/4/2026 đến hết 29/10/2026 = 192 ngày.
- Tiền chậm nộp: 40.000.000 × 0,03% × 192 = 2.304.000 đồng.
Nếu chờ cơ quan thuế kiểm tra, công ty còn có thể bị phạt khai sai tính theo số thuế khai thiếu.
Khai bổ sung thuế GTGT có bị phạt không?
Khai bổ sung đúng thời điểm thì không bị phạt hành vi khai sai. Theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP (đã sửa đổi), không xử phạt khi người nộp thuế khai bổ sung và nộp đủ tiền thuế trước khi cơ quan thuế công bố quyết định kiểm tra, thanh tra tại trụ sở, hoặc trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền khác phát hiện sai sót.
Tiền chậm nộp không phải tiền phạt, nên vẫn phải nộp. Từ 16/01/2026, khai sai nhiều chỉ tiêu trên cùng hồ sơ chỉ bị phạt một hành vi có khung cao nhất.
Câu hỏi thường gặp về khai bổ sung thuế GTGT
Phát hiện sai khi chưa hết hạn nộp tờ khai thì làm gì?
Theo hướng dẫn hiện hành, nếu chưa hết thời hạn nộp hồ sơ khai thuế, bạn nộp tờ khai thay thế, không phải khai bổ sung và không phát sinh tiền chậm nộp.
Bỏ sót hóa đơn đầu vào có được khai bổ sung tăng khấu trừ không?
Được, nếu hóa đơn đủ điều kiện khấu trừ. Số tăng ghi vào chỉ tiêu điều chỉnh tăng số thuế còn được khấu trừ của các kỳ trước.
Một kỳ có được khai bổ sung nhiều lần không?
Được. Mẫu 01/KHBS có chỉ tiêu "số lần khai bổ sung"; mỗi lần phát hiện sai sót mới, bạn lập một hồ sơ.
Chủ động khai bổ sung thuế GTGT trước khi bị kiểm tra
Khai bổ sung thuế GTGT càng sớm, tiền chậm nộp càng thấp và doanh nghiệp tránh được tiền phạt khai sai. Bạn nên đối chiếu hóa đơn với tờ khai mỗi kỳ. Các điểm mới khác của sắc thuế này xem tại thuế giá trị gia tăng 2026.
Liên hệ Luật Dân Việt để được tư vấn
Nếu bạn cần rà soát hồ sơ hoặc muốn Luật Dân Việt thực hiện thủ tục thay, hãy liên hệ để được tư vấn cụ thể theo tình huống của doanh nghiệp:
- Hotline: 0858.111.929
- Email: tuvanluatdanviet@gmail.com
- Văn phòng Hà Nội: 219 Trung Kính, Yên Hoà, Hà Nội; Toà HH2, FLC Garden City, Đại Mỗ, Hà Nội
Căn cứ pháp lý
- Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15 (khoản 5 Điều 12, khoản 2 Điều 16).
- Nghị định số 252/2026/NĐ-CP ngày 30/6/2026 của Chính phủ quy định chi tiết Luật Quản lý thuế.
- Thông tư số 89/2026/TT-BTC ngày 30/6/2026 của Bộ Tài chính hướng dẫn Luật Quản lý thuế.
- Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15, được sửa đổi, bổ sung bởi Luật số 149/2025/QH15 và Luật số 09/2026/QH16; Nghị định số 181/2025/NĐ-CP.
- Nghị định số 174/2025/NĐ-CP quy định giảm thuế GTGT đến hết 31/12/2026.
- Nghị định số 125/2020/NĐ-CP, được sửa đổi, bổ sung bởi Nghị định số 102/2021/NĐ-CP, Nghị định số 310/2025/NĐ-CP và Nghị định số 291/2026/NĐ-CP.
Thông tin trong bài mang tính tham khảo, được cập nhật theo văn bản pháp luật có hiệu lực tại thời điểm đăng. Quy định có thể thay đổi; vui lòng đối chiếu văn bản gốc hoặc liên hệ luật sư trước khi thực hiện.
